九州ku娱乐-新型冠状病毒与SARS病毒属于同一个“种”,但不是同一个“簇”

九州ku娱乐-新型冠状病毒与SARS病毒属于同一个“种”,但不是同一个“簇”

对于病毒的种类的划分保守区域的同源性才是关键。2019新型冠状病毒与SARS病毒的7个基因片段的同源性高于90%,根据这一标准,新型冠状病毒与SARS病毒属于同一个“种”。

【版权声明】本文由《科技日报》创作,在深圳市腾讯计算机系统有限公司下属平台独家发布,未经授权,不得转载。

科技日报记者 张佳星

2月9日,中国工程院院士、华中农业大学教授陈焕春表示,新型冠状病毒使用与SARS冠状病毒相同的细胞进入受体,与蝙蝠中发现的SARS相关病毒拥有87.1%的相似形,与SARS病毒有79.5%的相似度。与一个云南的蝙蝠样本中发现的冠状病毒的相似度高达96%。分析发现,新型冠状病毒属于SARS冠状病毒。

视频截图

同日,中国疾控中心病毒所所长许文波表示:不认为新型冠状病毒与SARS病毒是同一个病毒。

随后,陈焕春接受新华社记者采访时说,新型冠状病毒不是SARS冠状病毒,此前在湖北新冠肺炎疫情防控工作例行新闻发布会上的表述存在口误。

微博截图

新型冠状病毒和SARS病毒究竟是什么关系?科技日报记者独家采访病毒学专家、美国加州大学圣迭戈分校医学院教授Robert Naviaux。

有图有真相。根据Genebank数据库里给出的冠状病毒的基因序列,Robert教授利用通用分析软件phyloT计算出不同病毒间的基因关系图。

如图,红色箭头所示是2019新型冠状病毒根据与其他病毒的亲缘关系所在的位置。Robert教授解释,可以看出新型冠状病毒和SARS病毒属于同一种(Species),被称为类SARS病毒种(SARS-like Species), 又或者叫SARS相关病毒种(SARS-related Species),英文叫法不统一,没有国际标准。但也可以看出它们不属于同一“簇”,2019新型冠状病毒属于蝙蝠-类冠状病毒簇,SARS病毒属于SARS簇。

国际病毒分类系统采用目、科、亚科、属、种分类单元,2005年国际病毒命名委员会第8次分类报告,进一步明确了“种”作为病毒分类系统种的最小分类阶元。确切地说,新型冠状病毒与SARS病毒均属于冠状病毒科、冠状病毒亚科、β冠状病毒属、类SARS冠状病毒种。

相关资料的进化树如上图所示,2019年12月在武汉发现的病毒在红框内标红的位置,它的下方有多个以“SARS”字样命名的病毒。

这张图如同“族谱”,显示了新型冠状病毒在整个冠状病毒家族中的位置。它的“定位”遵守冠状病毒种类划分的规定(只有基因组序列完整的病毒能够使用以下标准划分):新发现的冠状病毒在保守结构域(ADRP、nsp5(3CLpro)、nsp12(RdRp)、nsp13(Hel)、nsp14(ExoN)、nsp15(NendoU)和nsp16(O-MT))中与已经发现的病毒有90%以上的同源性,则认为新发现的病毒属于该物种,这是“种”的划分标准。

可见,对于病毒的种类的划分保守区域的同源性才是关键。2019新型冠状病毒与SARS病毒的7个基因片段的同源性高于90%,根据这一标准,新型冠状病毒与SARS病毒属于同一个“种”。

来源:科技日报 文中图片除注明外由作者提供

更多精彩报道,尽在https://cataloweb.com